Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms