Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms