Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf3c1Q8K284 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms