Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c1Q8K193 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c1Q8K193 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c1Q8K193 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c1Q8K193 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c1Q8K193 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c1Q8K193 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c1Q8K193 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c1Q8K193 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Cldn34c1Q8K193 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c1Q8K193 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c1Q8K193 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c1Q8K193 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Cldn34c1Q8K193 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c1Q8K193 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Cldn34c1Q8K193 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c1Q8K193 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c1Q8K193 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c1Q8K193 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34c1Q8K193 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cldn34c1Q8K193 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c1Q8K193 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c1Q8K193 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c1Q8K193 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cldn34c1Q8K193 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c1Q8K193 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cldn34c1Q8K193 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cldn34c1Q8K193 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34c1Q8K193 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cldn34c1Q8K193 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cldn34c1Q8K193 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cldn34c1Q8K193 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cldn34c1Q8K193 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cldn34c1Q8K193 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34c1Q8K193 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34c1Q8K193 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cldn34c1Q8K193 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
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Cldn34c1Q8K193 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34c1Q8K193 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34c1Q8K193 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34c1Q8K193 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34c1Q8K193 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34c1Q8K193 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34c1Q8K193 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Cldn34c1Q8K193 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Cldn34c1Q8K193 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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