Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FgbQ8K0E8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FgbQ8K0E8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FgbQ8K0E8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FgbQ8K0E8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FgbQ8K0E8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FgbQ8K0E8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FgbQ8K0E8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FgbQ8K0E8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FgbQ8K0E8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FgbQ8K0E8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FgbQ8K0E8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FgbQ8K0E8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FgbQ8K0E8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FgbQ8K0E8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FgbQ8K0E8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FgbQ8K0E8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FgbQ8K0E8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FgbQ8K0E8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FgbQ8K0E8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FgbQ8K0E8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FgbQ8K0E8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FgbQ8K0E8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FgbQ8K0E8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FgbQ8K0E8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FgbQ8K0E8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FgbQ8K0E8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FgbQ8K0E8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FgbQ8K0E8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FgbQ8K0E8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FgbQ8K0E8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FgbQ8K0E8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FgbQ8K0E8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FgbQ8K0E8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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FgbQ8K0E8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FgbQ8K0E8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FgbQ8K0E8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FgbQ8K0E8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FgbQ8K0E8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FgbQ8K0E8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
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FgbQ8K0E8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FgbQ8K0E8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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FgbQ8K0E8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FgbQ8K0E8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FgbQ8K0E8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FgbQ8K0E8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FgbQ8K0E8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
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FgbQ8K0E8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FgbQ8K0E8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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FgbQ8K0E8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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FgbQ8K0E8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FgbQ8K0E8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FgbQ8K0E8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FgbQ8K0E8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FgbQ8K0E8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FgbQ8K0E8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FgbQ8K0E8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FgbQ8K0E8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FgbQ8K0E8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FgbQ8K0E8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FgbQ8K0E8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FgbQ8K0E8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FgbQ8K0E8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FgbQ8K0E8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
FgbQ8K0E8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FgbQ8K0E8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FgbQ8K0E8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FgbQ8K0E8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FgbQ8K0E8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FgbQ8K0E8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FgbQ8K0E8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FgbQ8K0E8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FgbQ8K0E8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FgbQ8K0E8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FgbQ8K0E8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FgbQ8K0E8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FgbQ8K0E8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FgbQ8K0E8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FgbQ8K0E8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FgbQ8K0E8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms