Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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SbsnQ8CIT9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbsnQ8CIT9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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SbsnQ8CIT9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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SbsnQ8CIT9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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SbsnQ8CIT9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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SbsnQ8CIT9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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SbsnQ8CIT9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SbsnQ8CIT9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SbsnQ8CIT9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms