Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF7

Tcerg1, Transcription elongation regulator 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcerg1Q8CGF7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tcerg1Q8CGF7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tcerg1Q8CGF7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tcerg1Q8CGF7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tcerg1Q8CGF7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tcerg1Q8CGF7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tcerg1Q8CGF7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tcerg1Q8CGF7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tcerg1Q8CGF7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcerg1Q8CGF7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcerg1Q8CGF7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcerg1Q8CGF7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcerg1Q8CGF7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcerg1Q8CGF7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcerg1Q8CGF7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcerg1Q8CGF7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcerg1Q8CGF7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcerg1Q8CGF7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcerg1Q8CGF7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcerg1Q8CGF7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcerg1Q8CGF7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcerg1Q8CGF7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcerg1Q8CGF7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcerg1Q8CGF7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcerg1Q8CGF7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcerg1Q8CGF7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcerg1Q8CGF7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcerg1Q8CGF7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcerg1Q8CGF7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcerg1Q8CGF7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcerg1Q8CGF7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcerg1Q8CGF7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcerg1Q8CGF7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcerg1Q8CGF7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcerg1Q8CGF7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcerg1Q8CGF7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcerg1Q8CGF7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcerg1Q8CGF7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcerg1Q8CGF7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tcerg1Q8CGF7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tcerg1Q8CGF7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
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