Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc43a2Q8CGA3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Slc43a2Q8CGA3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc43a2Q8CGA3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc43a2Q8CGA3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc43a2Q8CGA3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc43a2Q8CGA3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc43a2Q8CGA3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc43a2Q8CGA3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc43a2Q8CGA3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc43a2Q8CGA3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc43a2Q8CGA3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc43a2Q8CGA3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc43a2Q8CGA3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc43a2Q8CGA3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc43a2Q8CGA3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc43a2Q8CGA3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc43a2Q8CGA3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc43a2Q8CGA3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc43a2Q8CGA3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc43a2Q8CGA3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc43a2Q8CGA3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc43a2Q8CGA3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc43a2Q8CGA3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc43a2Q8CGA3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc43a2Q8CGA3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc43a2Q8CGA3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc43a2Q8CGA3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc43a2Q8CGA3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc43a2Q8CGA3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms