Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brf1Q8CFK2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brf1Q8CFK2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brf1Q8CFK2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Brf1Q8CFK2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brf1Q8CFK2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brf1Q8CFK2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brf1Q8CFK2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brf1Q8CFK2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brf1Q8CFK2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brf1Q8CFK2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brf1Q8CFK2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Brf1Q8CFK2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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