Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hpf1Q8CFE2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Hpf1Q8CFE2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Hpf1Q8CFE2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Hpf1Q8CFE2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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