Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx8Q8CFD4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms