Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms