Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nup88Q8CEC0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup88Q8CEC0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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