Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Lrrc9Q8CDN9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lrrc9Q8CDN9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lrrc9Q8CDN9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lrrc9Q8CDN9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lrrc9Q8CDN9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lrrc9Q8CDN9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lrrc9Q8CDN9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lrrc9Q8CDN9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lrrc9Q8CDN9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lrrc9Q8CDN9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lrrc9Q8CDN9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lrrc9Q8CDN9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lrrc9Q8CDN9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrrc9Q8CDN9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrrc9Q8CDN9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrrc9Q8CDN9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrrc9Q8CDN9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrrc9Q8CDN9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrrc9Q8CDN9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrrc9Q8CDN9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrrc9Q8CDN9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrrc9Q8CDN9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrrc9Q8CDN9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrrc9Q8CDN9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lrrc9Q8CDN9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lrrc9Q8CDN9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lrrc9Q8CDN9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lrrc9Q8CDN9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrrc9Q8CDN9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrrc9Q8CDN9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrrc9Q8CDN9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrrc9Q8CDN9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrrc9Q8CDN9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrrc9Q8CDN9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrrc9Q8CDN9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrrc9Q8CDN9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lrrc9Q8CDN9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lrrc9Q8CDN9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Lrrc9Q8CDN9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lrrc9Q8CDN9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lrrc9Q8CDN9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lrrc9Q8CDN9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lrrc9Q8CDN9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lrrc9Q8CDN9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms