Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lancl3Q8CD19 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lancl3Q8CD19 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lancl3Q8CD19 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lancl3Q8CD19 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lancl3Q8CD19 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lancl3Q8CD19 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lancl3Q8CD19 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lancl3Q8CD19 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lancl3Q8CD19 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lancl3Q8CD19 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lancl3Q8CD19 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lancl3Q8CD19 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lancl3Q8CD19 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lancl3Q8CD19 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lancl3Q8CD19 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lancl3Q8CD19 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lancl3Q8CD19 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lancl3Q8CD19 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lancl3Q8CD19 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lancl3Q8CD19 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lancl3Q8CD19 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms