Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwc2Q8C8N3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms