Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7D2

Crbn, Protein cereblon, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrbnQ8C7D2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CrbnQ8C7D2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CrbnQ8C7D2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms