Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Amigo3Q8C2S7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Amigo3Q8C2S7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Amigo3Q8C2S7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Amigo3Q8C2S7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Amigo3Q8C2S7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Amigo3Q8C2S7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Amigo3Q8C2S7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Amigo3Q8C2S7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Amigo3Q8C2S7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Amigo3Q8C2S7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Amigo3Q8C2S7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Amigo3Q8C2S7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Amigo3Q8C2S7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Amigo3Q8C2S7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Amigo3Q8C2S7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Amigo3Q8C2S7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Amigo3Q8C2S7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Amigo3Q8C2S7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Amigo3Q8C2S7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Amigo3Q8C2S7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Amigo3Q8C2S7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Amigo3Q8C2S7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Amigo3Q8C2S7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Amigo3Q8C2S7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Amigo3Q8C2S7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Amigo3Q8C2S7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Amigo3Q8C2S7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Amigo3Q8C2S7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Amigo3Q8C2S7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Amigo3Q8C2S7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Amigo3Q8C2S7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Amigo3Q8C2S7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Amigo3Q8C2S7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Amigo3Q8C2S7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Amigo3Q8C2S7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Amigo3Q8C2S7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
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