Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf428Q8C1M2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms