Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nek11Q8C0Q4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nek11Q8C0Q4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek11Q8C0Q4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek11Q8C0Q4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek11Q8C0Q4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek11Q8C0Q4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek11Q8C0Q4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek11Q8C0Q4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek11Q8C0Q4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek11Q8C0Q4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek11Q8C0Q4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek11Q8C0Q4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek11Q8C0Q4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek11Q8C0Q4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek11Q8C0Q4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek11Q8C0Q4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek11Q8C0Q4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek11Q8C0Q4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek11Q8C0Q4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek11Q8C0Q4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek11Q8C0Q4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek11Q8C0Q4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Nek11Q8C0Q4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nek11Q8C0Q4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nek11Q8C0Q4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nek11Q8C0Q4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Nek11Q8C0Q4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nek11Q8C0Q4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms