Protein–RNA interactions for Protein: Q8C079

Strip1, Striatin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strip1Q8C079 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Strip1Q8C079 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms