Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp47Q8BY87 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Usp47Q8BY87 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp47Q8BY87 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp47Q8BY87 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp47Q8BY87 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp47Q8BY87 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp47Q8BY87 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp47Q8BY87 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp47Q8BY87 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp47Q8BY87 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp47Q8BY87 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp47Q8BY87 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms