Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXF8

Actrt3, Actin-related protein T3, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt3Q8BXF8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms