Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp5Q8BX09 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms