Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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Usp38Q8BW70 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Usp38Q8BW70 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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Usp38Q8BW70 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Usp38Q8BW70 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Usp38Q8BW70 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Usp38Q8BW70 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Usp38Q8BW70 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Usp38Q8BW70 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp38Q8BW70 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
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