Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMG7

Rab3gap2, Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap2Q8BMG7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab3gap2Q8BMG7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab3gap2Q8BMG7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab3gap2Q8BMG7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab3gap2Q8BMG7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab3gap2Q8BMG7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab3gap2Q8BMG7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab3gap2Q8BMG7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rab3gap2Q8BMG7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms