Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms