Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnrc6bQ8BKI2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnrc6bQ8BKI2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms