Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJN4

Fndc9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc9Q8BJN4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms