Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH32

Susd4, Sushi domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd4Q8BH32 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Susd4Q8BH32 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Susd4Q8BH32 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Susd4Q8BH32 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Susd4Q8BH32 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Susd4Q8BH32 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Susd4Q8BH32 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Susd4Q8BH32 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Susd4Q8BH32 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Susd4Q8BH32 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Susd4Q8BH32 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Susd4Q8BH32 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Susd4Q8BH32 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Susd4Q8BH32 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Susd4Q8BH32 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Susd4Q8BH32 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Susd4Q8BH32 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Susd4Q8BH32 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Susd4Q8BH32 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Susd4Q8BH32 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Susd4Q8BH32 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Susd4Q8BH32 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Susd4Q8BH32 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Susd4Q8BH32 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Susd4Q8BH32 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Susd4Q8BH32 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Susd4Q8BH32 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Susd4Q8BH32 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Susd4Q8BH32 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Susd4Q8BH32 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Susd4Q8BH32 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Susd4Q8BH32 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Susd4Q8BH32 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Susd4Q8BH32 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Susd4Q8BH32 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Susd4Q8BH32 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Susd4Q8BH32 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Susd4Q8BH32 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Susd4Q8BH32 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Susd4Q8BH32 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Susd4Q8BH32 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Susd4Q8BH32 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms