Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms