Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA5

Krr1, KRR1 small subunit processome component homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krr1Q8BGA5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krr1Q8BGA5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms