Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Jmjd4Q8BFT6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms