Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.2Q85ZW9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms