Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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Atg4cQ811C2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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Atg4cQ811C2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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Atg4cQ811C2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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Atg4cQ811C2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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Atg4cQ811C2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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