Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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