Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cracr2bQ80ZJ8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Cracr2bQ80ZJ8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cracr2bQ80ZJ8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cracr2bQ80ZJ8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cracr2bQ80ZJ8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Cracr2bQ80ZJ8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cracr2bQ80ZJ8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cracr2bQ80ZJ8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cracr2bQ80ZJ8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cracr2bQ80ZJ8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cracr2bQ80ZJ8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Cracr2bQ80ZJ8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cracr2bQ80ZJ8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cracr2bQ80ZJ8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cracr2bQ80ZJ8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cracr2bQ80ZJ8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cracr2bQ80ZJ8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cracr2bQ80ZJ8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cracr2bQ80ZJ8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Cracr2bQ80ZJ8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Cracr2bQ80ZJ8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Cracr2bQ80ZJ8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Cracr2bQ80ZJ8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms