Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Kdm5bQ80Y84 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms