Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sestd1Q80UK0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sestd1Q80UK0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sestd1Q80UK0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sestd1Q80UK0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sestd1Q80UK0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sestd1Q80UK0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sestd1Q80UK0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sestd1Q80UK0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sestd1Q80UK0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sestd1Q80UK0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sestd1Q80UK0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sestd1Q80UK0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sestd1Q80UK0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sestd1Q80UK0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sestd1Q80UK0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sestd1Q80UK0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sestd1Q80UK0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sestd1Q80UK0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sestd1Q80UK0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Sestd1Q80UK0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms