Protein–RNA interactions for Protein: Q80U49

Cep170b, Centrosomal protein of 170 kDa protein B, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170bQ80U49 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cep170bQ80U49 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cep170bQ80U49 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms