Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Phf8Q80TJ7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf8Q80TJ7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf8Q80TJ7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf8Q80TJ7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf8Q80TJ7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf8Q80TJ7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf8Q80TJ7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf8Q80TJ7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf8Q80TJ7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf8Q80TJ7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf8Q80TJ7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms