Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSI3

Ppp6r1, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp6r1Q7TSI3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms