Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms