Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Shq1Q7TMX5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Shq1Q7TMX5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
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