Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sys1Q78S06 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sys1Q78S06 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sys1Q78S06 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sys1Q78S06 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sys1Q78S06 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms