Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl35Q6ZWV7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms