Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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