Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC8.02□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC8□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Syne2Q6ZWQ0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms