Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ncapd3Q6ZQK0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms