Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Topbp1Q6ZQF0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms